尽管我们通常从保护新鲜生产的木材的角度来考虑木材防霉处理的保存，但是对已经投入使用的木材的补充保护也有相当大的需求。这些治疗可以是外部的或内部的。

外部防腐剂包括前面提到的许多化学物质，但系统的配方可能不同。例如，木材的地下部分通常通过使用包含化学物质组合的防腐剂糊进行保护。通常，这些糊剂既包含打算保留在表面附近的油性化学品（例如环烷酸铜），又包含打算移入木材一定距离以控制任何已建立真菌的水溶性化学品（例如硼或氟化物）。这些处理通常以10-15年的间隔应用于现有的电线杆。挖出的杆深度为600–900 毫米，任何弱化的木材都会被刮掉。测量结构的剩余周长以确保其仍具有足够的结构能力，然后将糊剂涂在表面上，用塑料涂层的屏障覆盖，然后更换土壤。

内部治疗可以采取多种形式。最简单的方法是在空隙或其他内部缺陷中钻孔，然后在轻微压力下泵入防腐剂溶液。用于此方法的化学品包括环烷酸铜，硼和某些杀虫剂溶液。这种方法对涂有防腐剂的昆虫通道效果很好，但是对于真菌腐烂而言效果不佳，因为定居模式越分散，就越难将化学品泵送到需要的地方。较大的木材或木杆的内部可能是不透液体的心材，添加到空隙中的化学物质不太可能向木材中移动。

常规内部处理有两种方法可以阻止空隙中的衰减。第一种使用压缩成棒状的硼或氟化物。这些棒是通过在空隙上方和下方钻出的孔施加的。插入杆并将孔塞住。两极中的水分释放出化学物质，这些化学物质缓慢地扩散穿过木材，以阻止任何真菌侵袭。此过程所需的时间取决于木材种类和水分条件，但是要达到保护水平可能需要2到3年。这些处理的优点是化学药品的毒性较低。该处理的缺点是化学物质影响已建立的真菌所需的时间，因为真菌将继续降解木材直到化学物质水平达到保护阈值。

另一种内部处理方法是使用以气体（熏蒸剂）形式通过木材的化学物质。熏蒸剂最初是为种植前对土壤进行灭菌而开发的。尽管熏蒸剂在土壤中迅速降解，但其中某些化学物质与木材具有显着的相互作用，并且在施用后的2至20年内仍可检测到。像硼/氟化物棒一样，熏蒸剂是通过在腐烂区域上方和下方钻出的孔施加的。添加化学药品并堵塞孔。化学物质挥发并从孔中向上和向下移动。熏蒸剂的优势在于，它们通常会在处理后的1年内杀死已建立的真菌，从而最大程度地降低了进一步破坏木材的风险。四种熏蒸剂用于木材处理：氯化苦（三氯硝基甲烷），间位钠（32.1％钠）正甲基二硫代氨基甲酸酯），异硫氰酸甲酯（MITC）和达唑麦特。到目前为止，氯霉素是最有效的熏蒸剂，但也最难处理。结果，其使用仅限于远离居住区域的木材，因此其使用量急剧下降。Metam钠是另一种液体熏蒸剂，广泛用于木材和木杆。该化学物质逐渐被MITC和dazomet取代，它们在室温下均为固体。MITC通常应用于铝管中，并且挥发后会移入木材中。Dazomet是一种结晶性粉末，在水的存在下会分解产生MITC。所有这些治疗均能迅速消除真菌，并在治疗后至少4–7年内保持有效。氯霉素可提供长达20年的保护。